מוצרים

זרחון חלבון מסדיר תפקודים תאיים מגוונים וממלא תפקיד מפתח בהתפתחות המוקדמת של צמחים.כדי להשלים ולהרחיב מחקרים קודמים של זרחון חלבון בשתילי ארבידופסיס השתמשנו בגישה חלופית המשלבת מיצוי חלבון בתנאים לא-דנטורציה עם העשרת כרומטוגרפיה של זיקה מתכת-יון (IMAC) של פוספופרוטאינים שלמים בתמציות מדוללות רוביסקו, ולאחר מכן זיהוי. באמצעות אלקטרופורזה ג'ל דו מימדית (2-DE) וספקטרומטריית מסה טנדמית כרומטוגרפיה נוזלית (LC-MS/MS).עיכול טריפסין בג'ל וניתוח של כתמי ג'ל נבחרים זיהו 144 פפטידים ושאריות מזורחות, מתוכם רק 18 פוספופפטידים ו-8 פוספוסיטים נמצאו במאגרי המידע של אתרי הזרחון PhosPhAt 4.0 ו-P3DB Arabidopsis thaliana.יותר ממחצית מ-82 הפוספופרוטאינים שזוהו היו מעורבים בחילוף חומרים של פחמימות, בפוטוסינתזה/נשימה או ב-SMS מכני של תגובה ללחץ חמצוני.נראה שהעשרת פוספופרוטאינים שלמים לפני 2-DE ו-LC-MS/MS משפרת את הזיהוי של שאריות תריונין וטירוזין מזורחות בהשוואה לשיטות המשתמשות בהעשרה ברמת פפטיד, מה שמצביע על כך ששתי הגישות משלימות במידת מה במונחים של כיסוי אתרי זרחון.השוואת תוצאות עבור שתילים צעירים לאלה שהושגו בעבר עבור עלי ארבידופסיס בוגרים זיהתה חמישה חלבונים שזורחים באופן דיפרנציאלי ברקמות אלו, מה שמדגים את הפוטנציאל של טכניקה זו לחקור את הדינמיקה של זרחון חלבון במהלך התפתחות הצמח.